Фермент протеаза, расщепляющий белки на составляющие их аминокислоты, играет важную роль в жизненном цикле ретровирусов. Такие ферменты могут иметь сложную пространственную структуру, для определения которой необходимы значительные вычислительные мощности.
По словам представителя кафедры биохимии Вашингтонского университета Фираса Хатиба (Firas Khatib), для решения проблемы ученые призвали на помощь интуицию геймеров. Участникам Fold-it предложили решить трехмерную головоломку, подобрав оптимальный вариант строения фермента.
Результат игры (оптимальность структуры фермента) оценивался по аналогии с ферментами, чье пространственное строение уже известно. На то, чтобы подобрать наилучшую структуру протеазы ретровирусов, игрокам понадобилось всего три недели.
Исследователи доработали предложенный вариант и спустя несколько дней смогли определить точное строение фермента. По словам ученых, в молекуле протеазы уже удалось выявить потенциальные мишени для новых антиретровирусных лекарств, которые лишают фермент активности, передает Lenta.Ru.